Каспийское высшее военно-морское Краснознаменное училище имени С. М. Кирова было образовано в городе Баку в соответствии с программой строительства Рабоче-Крестьянского Военно-Морского Флота на 1938-1943 гг., разработанной Советом Народных Комиссаров, как 4 Военно-морское училище (4 ВМУ). 5 марта 1939 года Народный комиссар Военно-Морского Флота Н. Г. Кузнецов утвердил генеральный план строительства флота, а с 14 апреля 1939 года началось формирование 4 ВМУ на базе большой группы офицеров командного и преподавательского состава и группы курсантов Высшего военно-морского училища имени М. В. Фрунзе, прибывших в Баку из города Ленинграда во главе с комдивом Буриченковым Георгием Андреевичем, ставшим первым начальником училища. 1 мая 1939 года приказом Народного комиссара ВМФ СССР № 317 было объявлено о сформировании 4 военно-морского училища. Прибывшие из Ленинграда курсанты и офицеры при поддержке бакинцев, моряков Каспийской флотилии в короткие сроки на голом пустыре селения Зых воздвигли стены учебных и жилых корпусов, столовой и клуба, домов для проживания семей офицерского состава. Приказом НК ВМФ СССР № 241 от 25 июня 1939 года 4 военно-морское училище было переименовано в Каспийское военно-морское училище (КВМУ). С 1 августа по 1 октября 1939 года в училище было зачислено 675 человек. 31 августа 1939 года на 2 курс КВМУ переведена часть курсантов Ленинградского ВВМУ имени М.В. Фрунзе, окончивших первый курс. 1 октября 1939 года с торжественного построения и объявления поздравительной телеграммы народного комиссара ВМФ в палаточном городке училища начался первый учебный семестр: 1 курс - курсанты нового набора, 2 курс - 2 группы курсантов, прибывших из ВВМУ имени М.В.Фрунзе. 19 ноября 1939 года для обеспечения учебного процесса училищу были переданы несколько парусных, парусно-моторных шхун и катеров типа «Рыбинец». В зимний период занятия с курсантами 1 курса проводились в здании Азербайджанского сельскохозяйственного института и на учебном корабле «Правда», 2 курс был направлен на учебу на учебные корабли Черноморского флота. 5 июля 1940 года постановлением Совета Народных Комиссаров училище было переведено в разряд высших и стало именоваться Каспийским высшим военно-морским училищем. 1 октября 1940 года начало второго учебного года было совмещено со сдачей в эксплуатацию учебного корпуса № 1. В январе 1941 года были введены новые воинские звания. Приказом начальника училища № 97 от 3 марта 1941 года всем младшим командирам были присвоены воинские звания: помощникам командира взвода — старшина 1 статьи, командирам отделений — старшина 2 статьи, восемнадцати курсантам, исполнявшим обязанности старшин рот и курсов, было присвоено воинское звание «главстаршина».
22 июня 1941 года в 14 часов 25 минут был получен условный сигнал, по которому началась мобилизация Каспийской флотилии. С началом Великой Отечественной войны училище перешло на ускоренную подготовку. Летнюю практику курсанты проходили в Севастополе на кораблях Черноморского флота. После начала войны они под руководством своих преподавателей участвовали в строительстве новых оборонительных укреплений и в уничтожении вражеских парашютистов-лазутчиков. Другая группа курсантов привлекалась к выполнению боевых заданий на Каспийской флотилии. С 1 июля по 14 августа 1941 года на 1 курс училища было зачислено 331 человек. В августе 1941 года училищу передан оборонительный район на Апшеронском полуострове. Для его обороны из личного состава училища был сформирован полк, в состав которого вошли 3 батальона. С 23 по 26 августа 1941 года личный состав училища в составе Каспийской флотилии участвовали в высадке морского десанта на побережье Ирана в районе порта Пехлеви (ныне Бендер-Энзели). Для участия в высадке десанта были направлены 16 офицеров, 252 курсанта и 2 краснофлотца (Приказ начальника КВВМУ № 052 от 28.08.1941 г.). 9 сентября по указанию начальника ПУ НК ВМФ на базе КВВМУ были сформированы краткосрочные курсы по подготовке политработников запаса. Численный состав курса 100 человек(первый выпуск был произведен 25 октября 1941 года).
28 - 29 сентября 1941 года под руководством заместителя Наркома ВМФ корпусного комиссара Игнатьева С. П. состоялась проверка действия «первой сотни» училища на тактическом учении. Она завершилось торжественным построением, на котором был зачитан приказ о досрочном выпуске курсантов 4 курса роты майора Осадчука А.И. 106 выпускников стали лейтенантами. «Первая сотня» была направлена на Черноморский флот и с ходу вступила в бой.
11 октября 1945 года из Севастополя в Баку была переведена часть Черноморского высшего военно-морского училища.
Приказом начальника ВМУЗ № 368 от 1 ноября 1941 года 265 курсантов 1 и 2 курсов в званиях «старшина 1 статьи» и «главный старшина» и часть офицеров училища были откомандированы в распоряжение командующих военными округами для формирования отдельных морских стрелковых бригад в следующем составе: 75 отдельная стрелковая бригада – 100 человек; 74 – 63 человека; 70 – 29 человек; 69, 72, 73 по 25 человек; 71 – 8 человек; 63, 66, 67, 79, 82 и 85 по 2-4 человека.
В ноябре 1941 года начальник КВВМУ капитан 1 ранга Сухиашвили Константин Давидович был назначен командиром 75 отдельной морской стрелковой бригады, которая была сформирована в городе Казалинске Казахской ССР. В составе бригады воевали 100 бывших курсантов, все командные должности от командиров взводов до командиров батальонов были укомплектованы воспитанниками училища. Бригада воевала под Москвой, в районе Старой Руссы, прошла с боями вдоль рек Редья и Ловать около 200 км, освободила от фашистов свыше 70 населенных пунктов, захватив множество военной техники противника. В условиях суровой зимы 1941- 42 года моряки-каспийцы с боями прошли свыше 400 км, освободив около 700 населенных пунктов. За успешное окружение и уничтожение Холмской группировки, за боевые заслуги в боях за Родину 17 марта 1942 года 75 оморсбр была преобразована в 3 гвардейскую отдельную стрелковую бригаду. В статье, опубликованной 1 мая 1942 года в газете «Красная звезда» Герой Советского Союза, командир 2 гвардейского стрелкового корпуса генерал-майор Лизюков А.И. писал: «…Совсем недавно гвардейская часть Сухиашвили показала такую выдержку и упорство, перед которыми меркнет слава многих знаменитых подвигов гвардии прошлых лет… Немцы встретились с железным потоком, сметавшим на своем пути всякое сопротивление… Вот так воюют советские гвардейцы. Так в боях сложилось твёрдое понятие о воинской чести нашей гвардии: презрение к смерти во имя Победы».
15 ноября 1941 года в училище произведен второй досрочный выпуск офицеров. Приказом Народного комиссара ВМФ СССР № 02265 выпускникам было присвоено военное звание лейтенант и все они были направлены в распоряжение Военных Советов военных округов для укомплектования частей морской пехоты (отдельных морских стрелковых бригад). Так, например, в 72 отдельной морской стрелковой Краснознаменной бригаде в Заполярье воевали 25 выпускников училища.
16 ноября 1941 года из Севастополя на Каспий было передислоцировано Военно-морское училище береговой обороны имени ЛКСМУ, которое к началу 1942 года было переведено в город Ленкорань Азербайджанской ССР. 13 января 1942 года в КВВМУ прибыли курсанты Военно-морского пограничного училища НКВД и были зачислены курсантами на: 1 курс – 133 человека, 2 курс – 268 человек, 3 курс – 95 человек. Многие из них с августа 1941 по январь 1942 года получили боевое крещение на Ленинградском фронте на правом берегу Невы у Ивановских порогов. 15 января 1942 года согласно приказу НК ВМФ СССР № 022 от 15.01.42 г. об организации курсов по подготовки командиров катеров, в КВВМУ были организованы курсы по подготовке офицеров-артиллеристов для речных судов, выпуск которых произведен 6 февраля 1942 года. 12 февраля года были организованы курсы по подготовке инструкторов-маскировщиков кораблей ВМФ, выпуск произведен 5 мая 1942 года. В августе 1942 года из блокадного Ленинграда в Баку были эвакуированы Высшее военно-морское училище им. Ф.Э. Дзержинского вместе с командным и профессорско-преподавательским составом в количестве около 300 человек, Высшее военно-морское училище им. М.Ф. Фрунзе, Военно-морское медицинское училище. 5 августа 1942 года в КВВМУ были организованы краткосрочные курсы подготовки помощников командиров взводов из курсантов 1 курса в количестве 100 человек. В начале августа 1942 года группа курсантов училища была направлена под Сталинград.
21 августа 1942 года Каспийское высшее военно-морское училище временно прекратило свое существование. В соответствии с Директивой начальника ВМУЗ № 5081 КВВМУ было объединено с Высшим военно-морским ордена Ленина Краснознаменным училищем им. М.В. Фрунзе. Курсантский состав и преподаватели были переданы в распоряжение командования училища им. М.В. Фрунзе. В октябре 1942 года для обороны Кавказа в районе Сумгаита срочно формировалась 34 отдельная стрелковая бригада, в состав которой влились две роты автоматчиков, сформированные из курсантов 2 курса. В ноябре 1942 года 34 отдельная стрелковая бригада полковника Ворожищева А.В. более десяти дней героически отстаивали Суарское ущелье (село Майрамадаг).
К концу 1942 года в Баку из Москвы было переведено Управление Военно-Морских учебных заведений, сформирован Центр подготовки офицеров флота и открыты многочисленные курсы по подготовке различных военных специалистов для ВМФ.
1 июня 1944 года в соответствии с приказом НК ВМФ № 0345 Каспийское высшее военно-морское училище было воссоздано в городе Баку. В училище начало прибывать фронтовое пополнение. С фронтов возвращались преподаватели, бывшие курсанты, прибывало новое пополнение, среди них более 10 Героев Советского Союза, более 40 орденоносцев - кавалеров орденов «Слава», «Красного Знамени», «Красная Звезда», более 100 человек, награжденных медалями «За отвагу», «За боевые заслуги», «За оборону Ленинграда», «За оборону Севастополя», «За оборону Одессы», «За оборону Москвы» «За оборону Кавказа», «За оборону Советского Заполярья», медалью Нахимова и другими наградами Родины.
4 марта 1945 года Каспийскому высшему военно-морскому училищу как воинской части, «доказавшей свою выдающуюся храбрость в боях с врагами социалистического Отечества», от имени Президиума Верховного Совета СССР было вручено Красное Знамя части (с 1975 года - Боевое Знамя училища).
За годы войны 14 выпускников-каспийцев стали Героями Советского Союза. Это Георгий Матвеевич Агафонов, Алексей Иванович Афанасьев, Борис Петрович Бувин, Владимир Поликарпович Гуманенко, Константин Иванович Воробьев, Анатолий Сергеевич Марков, Георгий Михайлович Паламарчук, Василий Васильевич Поляков, Сергей Никитович Решетов, Александр Васильевич Райкунов, Михаил Андрианович Соколов, Яков Яковлевич Швачко, а разведчик Виктор Николаевич Леонов и катерник Александр Осипович Шабалин удостоены этого высокого звания дважды.
Решением Народного комиссара ВМФ от 26 января 1946 года при училище были сформированы «параллельные классы» для моряков, ставших офицерами в годы войны, но не имевших высшего образования. В них пришли прославленные катерники, разведчики и участники множества операций в годы войны. 7 ноября 1949 года сводный полк курсантов КВВМУ под командованием начальника училища контр-адмирала Ванифатьева А.Г. впервые участвовал в параде войск Московского гарнизона на Красной площади в Москве. За хорошую строевую выправку, дисциплину и организованность личному составу была объявлена благодарность ГК ВМС.
За годы своего существования, отвечая потребностям флота, училище готовило разных специалистов. До 1952 года училище выпускало вахтенных командиров, а с 1 сентября 1952 года училище перешло на обучение по специальностям: штурман, артиллерист и минер.
9 декабря 1954 года указом Президиума Верховного Совета СССР, приказом Министерства обороны СССР, Каспийскому ВВМКУ было присвоено имя Сергея Мироновича Кирова, видного партийного и государственного деятеля, и этот день объявлен годовым праздником училища.
В конце 1950-х годов артиллерийский и минный факультеты были переведены в другие училища, а в 1960 году в Каспийском высшем военно-морском училище был организован новый факультет — химический.
Бурное строительство с конца 1950-х годов подводного ракетно-ядерного флота потребовало от системы образования ВМФ значительных количественных и качественных изменений. В подготовке для флота таких специалистов, как инженер-штурман и инженер-химик, Каспийское ВВМКУ имени С. М. Кирова внесло заметный вклад. Каспийцы гордятся, что у истоков создания советского атомного флота стояли его выпускники, многие из которых стали участниками важнейших свершений в истории флота