3 Белорусский фронт был создан на западном направлении решением Ставки Верховного Главнокомандования 24 апреля 1944 года путем переименования Западного фронта. Войска 3 Белорусского фронта принимали участие в Витебско-Оршанской стратегической наступательной операции (23 - 28 июня 1944 года), Вильнюсской (5 - 20 июля 1944 года) и Каунасской (28 июля - 28 августа 1944 года) наступательных операциях. В начале октября 1944 года фронт силами 39 и 1 воздушной армий участвовал в Мемельской наступательной операции (5 - 22 октября 1944 года).
Во второй половине октября 1944 года силами 3 Белорусского фронта была проведена Гумбиннен-Гольдапская фронтовая наступательная операция (16 - 30 октября 1944 года), в ходе которой войска фронта продвинулись на глубину от 30 до 60 км в Восточную Пруссию и в Северо-Восточную Польшу, овладели городами Шталлупенен (ныне Нестеров Калининградской области), Голдап, Сувалки.
В январе - апреле 1945 года войска 3 Белорусского фронта участвовали в Восточно-Прусской стратегической наступательной операции (13 января - 25 ареля 1945 года), в ходе которой 13 - 21 января провели Инстербургско-Кёнигсбергскую фронтовую наступательную операцию. Во взаимодействии со 2 Белорусским фронтом они прорвали глубоко эшелонированную оборону, продвинулись на глубину 70 - 130 км, вышли на подступы к столице Восточной Пруссии городу Кёнигсберг (ныне Калининград) и блокировали восточно-прусскую группировку противника, а затем (13 - 29 марта) ликвидировали её и вышли к заливу Фришес-Хафф (ныне Калинигнградский или Вислинский залив).
С 6 по 9 апреля 1945 года войска фронта провели Кёнигсбергскую наступательную операцию, в результате которой штурмом овладели крепостью и городом Кёнигсберг), 25 апреля 1945 года, завершив ликвидацию земландской группировки войск противника, овладели портом и городом Пиллау (ныне Балтийск Калининградской области).
По окончании Великой Отечественной войны соединения и части 3 Белорусского фронта дислоцировались в бывшей Восточной Пруссии на территории нынешней Калининградской области и Польши.
15 августа 1945 года на основании приказа НКО СССР от 09.07.1945 года 3 Белорусский фронт был расформирован, полевое управление фронта было обращено на формирование управления Барановичского военного округа.