Сформирован на основе приказа Наркома ВМФ СССР от 23.12.1939 г. как 72-й смешанный авиаполк.
Входил в состав ВВС Северного флота (ВВС СФ). К началу войны включал 4 истребительные и одну бомбардировочную эскадрильи. Вооружение: 1-я и 2-я АЭ - И-15бис, 3-я АЭ - И-153, 4-я АЭ - И-16, 5-я АЭ - СБ. В конце сентября 1941 года получил несколько английских истребителей "Харрикейн", а позже еще порядка 90 таких самолетов. 11.11.1941 г. в полк было включено звено ДБ-ЗФ из 1-го мтап ВВС БФ, возглавляемое И.Гарбузом. Приказом Народного комиссара ВМФ СССР № 10 от 18.01.1942 г. полк преобразован во 2-й гв.сап ВВС СФ.
23.03.1942 г. в полк прибыли шесть ДБ-ЗФ, возглавляемых капитаном Г. Поповым, из 4-го мтап ВВС ТОФ, которые вместе с машинами, прибывшими раньше, составили 6-ю минно-торпедную АЭ 2-го гв.сап ВВС СФ. Во второй половине 1942 года эскадрилья начала действовать в соответствии со своим названием. В марте 1942 года на базе двух эскадрилий 2-го гв.сап ВВС СФ был сформирован 27-й иап ВВС СФ. 2-й гв.иап ВВС ВМФ сформирован 14.10.1942г. путем преобразования из 2-го гвардейского смешанного авиационного полка ВВС СФ. 2-й гв.иап ВВС СФ в январе 1943 года полк вошел в состав 6-й иабр ВВС СФ, затем переименованную в 6-ю иад ВВС СФ.